问题1: 油墨功能仍然缺乏
水性油墨以水为主要溶剂，水的蒸发潜热大，常温下蒸发速度慢，因此其流平性、附着力、光泽度都比溶剂型油墨差，印刷质量问题简单发生；其次是溶解性，水性油墨的溶解性取决于水性乳液和色浆之间的溶解性和消光性的相容性，在生产中需要经常搅拌。而且不同品牌的水性油墨有不同的安全储存期，超过安全储存期的水性油墨只是沉淀或分层。即使搅拌没有起到很大的作用，这时也会出现不可避免的刀线问题，甚至更加严重。
问题2:生产流程需要调整
由于水性油墨用于水性树脂干燥是不可逆的，如果还选用传统的“倒金刚石”雕花凹版网点，随着使用时间的延长，干燥油墨固定在网点底部会造成网点堵塞，导致油墨转移不足，进而影响印刷色相的一致性。在这方面，一方面需要使用方形网点的激光雕刻凹版，另一方面需要对凹版进行及时彻底的清洗，否则镗孔后的整个凹版将报废。
问题3:资金方面有所顾忌
鉴于目前的情况，丝网印刷水性油墨的确比溶剂型油墨的选择成本要高。一方面，水性油墨以水性树脂为环节，其收购价格远高于普通溶剂的价格; 另一方面，要适应水性油墨的印刷特点，在生产能耗、设备改造等方面或多或少也需要做一些投资。因此，对于那些尚未涉足水性油墨玻璃丝网印刷领域的企业来说，这将在一定程度上增添他们的顾虑。
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